Genoma viruela del mono
Viruela del mono
Investigadores españoles hallan la secuencia completa del genoma del virus de la viruela del mono
El Instituto de Salud Carlos III ha logrado obtener el estudio más completo del virus obtenido hasta el momento
Investigadores del Instituto de Salud Carlos III (ISCIII), dependiente del Ministerio de Sanidad, han logrado obtener el primer borrador de secuencia completa del virus de la viruela del mono. Lo han logrado gracias a la realización de análisis genómicos de 23 pacientes.
Esta labor de secuenciación masiva ha permitido confirmar que la variedad de África Occidental es la causante de este brote ya extendido por varios países del mundo.
La secuenciación ha logrado alcanzar una cobertura del cien por cien de los 190.000 pares de bases del genoma de este virus, lo cual abre la posibilidad de estudios filogenéticos más avanzados que permitirán obtener información adicional sobre su comportamiento y comprender mejor su origen, circulación y difusión.
SE considera un avance en el mundo científico, ya que se trata de la secuenciación genómica más completa que se ha realizado hasta ahorra. El Laboratorio de Arbovirus del ISCIII, en conjunto con las unidades de Genómica y Bioinformática han sido los encargados de ejecutar el estudio. Además, han contado con las referencias publicadas en los últimos días por otros países (Bélgica, Alemania, Portugal y Estados Unidos).
Se ha llevado a cabo gracias a una tecnología genómica de nueva generación mapeada contra genoma de referencia, a lo que se ha sumado un análisis complementario de las muestras mediante una técnica conocida como ensamblado de novo.
Las secuencias en crudo finalizaron el pasado lunes, y el análisis de computación se ha realizado en las últimas 36 horas. Los resultados señalan que las muestras secuenciadas pertenecen a los mismos brotes detectados en el resto de países europeos con casos notificados, ya que los genomas obtenidos apenas difieren de los ya secuenciados en otros países.
En concreto, el análisis realizado en el ISCIII concluye que hay menos de 5 SNP (secuencias genéticas denominadas cambios de nucleótidos sencillos) de diferencia respecto a la secuenciación llevada a cabo en Alemania.
La secuenciación ha confirmado que los brotes de viruela del mono identificados en España pertenecen a África Occidental, el de menor virulencia registrado hasta el momento.
Tras obtener la secuencia completa del virus, varios equipos de investigadoras del ISCIII están llevando a cabo análisis filogenéticos para conocer la relación entre las muestras españolas y las de otros países.
La información obtenida se enfrentará a las ya conocidas y depositadas en bases de datos internacionales para evaluar el grado de identidad y, en su caso, la localización de las diferencias que pudieran existir entre la secuencia española y los demás datos internacionales. Todo ello permitirá realizar los estudios de trazabilidad del brote, así como identificar potencialmente su origen.
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