Desarrollan una tecnología que podría acabar con la temida resistencia a los antibióticos

Las infecciones por bacterias resistentes a los antibióticos son cada vez más difíciles de tratar y causan más de un millón de muertes al año en todo el mundo. Como las cabezas de la Hidra, las bacterias pueden desarrollar mutaciones de resistencia a los antibióticos al poco de comenzar con el tratamiento, lo que obliga a cambiar la medicación, solo para que estos microorganismos vuelvan a ser reemplazados por otros también resistentes.

Una nueva tecnología de vigilancia genómica en tiempo real podría ayudar a los médicos a controlar con mayor rigurosidad las mutaciones que generan la resistencia, lo que facilitaría un tratamiento más adecuado, más oportuno y más eficaz para las infecciones agudas.

En un artículo publicado en la revista Nature Communication, científicos de varias instituciones estadounidenses han descrito esta tecnología, conocida como secuenciación profunda de amplicones dirigida por resistencia –RETRA-Seq–.

«A veces, los médicos intentan administrar un determinado antibiótico durante un tiempo para cambiar luego a otro diferente», comenta Gregory Priebe, médico del Boston Children’s y uno de los autores del artículo. «Los ensayos clínicos han tenido resultados mixtos al usar este enfoque de ciclo de antibióticos en grupos grandes, pero se desconoce qué sucede en pacientes determinados», añade.

El objetivo de los investigadores es probar el ciclo de los antibióticos en pacientes individuales, junto a una vigilancia genómica de sus poblaciones bacterianas. Esto permitiría elegir la elección y el momento de los antibióticos a medida que cambian las frecuencias de las mutaciones de resistencia.

En su investigación, el equipo combinó la secuenciación del genoma completo de las bacterias con RETRA-Seq en busca de cambios en las frecuencias de las diferentes mutaciones de resistencia a los antibióticos a lo largo del tiempo.

Las pruebas clínicas a veces pasan por alto bacterias resistentes a los antibióticos

«En las pruebas clínicas de susceptibilidad a los antibióticos, analizamos algunas colonias de bacterias y podemos pasar por alto algunas que hayan desarrollado resistencia a los antibióticos», explica Alex McAdam, director médico del Laboratorio de Diagnóstico de Enfermedades Infecciosas y coautor del artículo. «RETRA-Seq analiza la población bacteriana en su conjunto, detectando bacterias raras resistentes a los antibióticos con una sensibilidad mayor que los actuales métodos clínicos», señala.

Para llevar a cabo el estudio, los investigadores examinaron a siete pacientes con ventilación artificial en el Boston Children’s con infecciones por pseudomonas aeruginosa en las vías respiratorias bajas. En primer lugar, secuenciaron el genoma completo de las colonias bacterianas encontradas en los pacientes.

«Para nuestra sorpresa, descubrimos que las bacterias se volvían más diversas genómicamente a lo largo del tiempo. Las mutaciones que vimos afectaron, no solo a los reguladores de la virulencia, sino también a muchos genes y vías de resistencia a los antibióticos», apunta Priebe.

Los investigadores desarrollaron RETRA-Seq para medir las frecuencias de las mutaciones y descubrieron que estas cambiaban en algunos pacientes al mismo ritmo que los cambios de antibióticos.

Así, concluyeron que la vigilancia genómica en tiempo real podría beneficiar a pacientes con infecciones pulmonares crónicas, así como a enfermos críticos por covid.

Entre el 30 y el 50 % de los pacientes con ventilación artificial desarrollan neumonía

«Entre el 30 y el 50 % de los adultos que requieren intubación con ventilación artificial por covid desarrollan neumonía asociada al ventilador», asegura Priebe. «Con más estudios, esperamos que una técnica como RETRA-Seq pueda ayudarnos a elegir un antibiótico que no provoque la expansión de bacterias resistencias de baja frecuencia que están al acecho en nuestros pacientes».

«El objetivo es encontrar el antibiótico correcto en el momento adecuado, lo que debería conducir a mejores resultados para los pacientes», concluye.