Nudibranquio Peltodoris atromaculata
Ciencia
Científicos españoles consiguen obtener ADN de alta calidad gracias a un método totalmente revolucionario
En concreto, han obtenido ADN «de calidad» de una especie de nudibranquio, un molusco marino sin concha, de cuerpo blando y colores llamativos
El grupo de investigación de Mária Dzunková, del Instituto de Biología Integrativa de Sistemas (I2SysBio), centro mixto de la Universidad de Valencia (UV) y del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), ha conseguido métodos de extracción de ADN de animales, recolectados en campo en condiciones «no ideales».
En concreto, han obtenido ADN «de calidad» de una especie de nudibranquio –moluscos marinos sin concha, de cuerpo blando y colores llamativos– en seis de las 24 combinaciones practicadas. El trabajo se ha publicado en la revista 'Ecology and Evolution', según ha informado la institución académica en un comunicado.
Esta investigación se enmarca en la Iniciativa Catalana per a l'Earth Biogenome Project (CBP), una rama regional del proyecto Earth BioGenome Project (EBP), que busca secuenciar y catalogar los genomas de todas las especies eucariotas conocidas. En concreto, el CBP pretende secuenciar los genomas de más de 40.000 especies que habitan en territorios de habla catalana.
Nudibranquio Peltodoris atromaculata
En el estudio publicado se evaluaron 24 combinaciones de conservación y extracción de ADN en un ejemplar del nudibranquio Peltodoris atromaculata. Como los nudibranquios suelen recolectarse en lugares remotos, es necesario aplicar métodos de conservación que pueden afectar a la calidad del ADN, con lo que se dificulta la obtención del material requerido por las técnicas de secuenciación de lectura larga, aquellas que permiten generar ensamblajes de lecturas «muy precisos y continuos», fundamentales para el estudio de la arquitectura genómica y la resolución de regiones complejas del genoma.
«Los resultados indican que el éxito de las extracciones de ADN de alto peso molecular está influido por los métodos de conservación», explica Mária Dzunková, quien apunta que el estudio aporta «resultados clave» al identificar combinaciones eficaces de conservación y extracción de ADN, «lo que permitirá generar genomas de referencia de alta calidad y contribuir al conocimiento y aprovechamiento sostenible de la biodiversidad marina».
Actualmente, aunque solo se ha secuenciado el genoma del 1% de las 2.545 especies de nudibranquios conocidas, existe «un creciente interés en este grupo por su extraordinaria diversidad biológica y sus complejos mecanismos de defensa química, con potencial en biotecnología y farmacología».
